In Lemony Snicket: Rätselhafte Ereignisse begleiten Fans der Baudelaire-Waisen diese von einer brenzligen Situation in die andere. Basierend auf der beliebten Bücherreihe und dem bevorstehenden Kinofilm mit Jim Carrey erlebt der Spieler die spannenden Abenteuer von Violet, Klaus und Sunny Baudelaire. Im Spiel müssen die einzigartigen Talente jedes der drei Waisen eingesetzt werden, damit sie ihrem entfernten Verwandten, dem bösen Graf Olaf, immer einen Schritt voraus bleiben - denn er wird vor nichts Halt machen, um ihr Vermögen in seine gierigen Finger zu bekommen.