ÜberSoldier 2 spielt im April 1945 und somit zu einer Zeit, als der Krieg für das Dritte Reich bereits so gut wie verloren ist. Die Alliierten stehen kurz vor Berlin, während Hitlers Gefolgschaft langsam auseinander fällt. Einige treue Generäle und Offiziere planen aber bereits das Überleben des Nationalsozialismus: Die gesamte Führungsriege des Dritten Reichs soll kurzerhand in ein abgelegenes Versteck in den tibetanischen Bergen verfrachtet werden. Dort sollen untote Übersoldaten die Sicherheit des Diktators gewähren damit dieser im Geheimen seine Rache planen kann. Du bist selbst ein Übersoldier, ein misslungenes Experiment, und die einzige Hoffnung das Ende des Diktators endgültig zu besiegeln.